Структура Фонда Академия образования Милана осуществляется на принципах экономии, эффективности и производительности, благодаря возможности использования значительного опыта ноу-хау, накопленного членами фонда, а также благодаря личному опыту известных в мире бизнеса специалистов и преподавателей высшей школы.
Руководящим органом Фонда является Совет директоров, который определяет стратегические линии и направления, а также контролирует результаты их выполнения, а также Научно-технический Комитет, который определяет направления работы и проекты.